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主角是名侦探金田一耕助的外孙金田一一和青梅竹马的“好友”七濑美雪、警察“朋友”剑持勇警部、“对手”明智健悟警视等伙伴，运用高超的推理能力，解决遭遇到的各种困难案件。
神秘的研究会会长樱树琉璃子拜托金田一协助揭开不动高中旧校舍七件不可思议事物之迷，金田一深夜的校园里见到怪人[放学后的魔术师]和樱树琉璃子的尸体！而且，以极短的时间赶到现场时，凶手和尸体却从密室中消失.....
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