时间设定在明治时期的新撰组。组员中的3个人都是女孩——性格大跳、男孩子气、无厘头却有着悲伤往事的组长近藤勇子；为了讨伐父亲的敌人：山县有朋而秘密加入新撰组的土方岁绘；性格外向，会使阴阳术和耍二刀流的高手冲田熏。 OVA剧情：唯一的一个为了为了还债而不得不加入新撰组的弓月·新太郎——自感正义但是脾气温顺，身兼参谋和帐务的职务。 TV剧情：在明治的新京都，佩戴着[许可证]的妖怪也在四下飞奔，在得到由官方发放的许可证后，可以和人类一起生活。其中，有一个专门逮捕没有得到许可证的妖怪人，以此来捍卫京都的治安的集团在奋斗着。他的名字就是株式会社新撰组。另一方面，时代巨变下杂乱无章的京都中，和伙伴妖怪猫丸一起刚从上海回来的少年出现了。他名叫坂本龙之介，而他将马上回到上海。 为了完成收养她们的坂本夫人的愿望，三人而一直努力着留住坂本龙之介。是一部描绘爱情和战争，悲伤却搞笑科幻历史剧。

机动新撰组 萌之剑全集播放地址：https://www.idm.cc/v/jidongxinzhuanzumengzhijian/"。支持爱动漫网（www.idm.cc），请推荐机动新撰组 萌之剑给小伙伴们。