有一天，主人公黑羽快斗得知8年前失踪的父亲——黑羽盗一就是怪盗基德，父亲的失踪与一个神秘组织有关。为了揭开父亲的死因，黑羽快斗决定继承父亲怪盗的职业和名字，成为了第二代怪盗基德，不顾生命危险，想引出杀害父亲的凶手。

在一次行动中，黑羽快斗偶然和一支称他为“黑羽盗一”的神秘组织相遇，得知神秘组织在图谋长眠于大批珠宝中的可获长生的“命运之石潘多拉”，而将妨碍到他们的黑羽盗一杀死。快斗因此开始了与神秘组织的交锋，为的是比组织更早一步找到“潘多拉”，粉碎他们的阴谋。

除了神秘组织和众警察的追捕，快斗同样要应付另一组实力强劲的对手——高中生侦探白马探和工藤新一。

《魔术快斗》小漫简评：记得看这部漫画的时候还很小，新一和基德绝对是一对失散多年的亲兄弟！绝对！青子和小兰也是失散多年的亲姐妹！绝对！

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